產(chǎn)品簡介
原核轉(zhuǎn)錄組測序分析是針對原核微生物設計開展的轉(zhuǎn)錄組學測序分析研究。微生物在特定生境或時期中會表現(xiàn)出基因表達差異性，以此應對環(huán)境變化。由于原核生物mRNA沒有polyA尾結(jié)構(gòu)，所以需要去除核糖體RNA、構(gòu)建鏈特異性文庫等實驗步驟，最終獲得特定時期或者環(huán)境下微生物體內(nèi)所有轉(zhuǎn)錄本（包括mRNA，非編碼RNA等）的表達量差異信息及功能特征，從而找出關鍵的差異功能基因。
研究內(nèi)容
1) 測序質(zhì)量值分布統(tǒng)計；
2) 測序堿基質(zhì)量控制；
3) 測序數(shù)據(jù)產(chǎn)出統(tǒng)計；
4) 與參考基因組比對分析；
5) 基因表達定量；
6) RNA-Seq整體質(zhì)量評估：Insert長度檢驗；測序隨機性分析；測序飽和度分析；
7) SNP分析；
8) 新轉(zhuǎn)錄本預測；
9) 基因結(jié)構(gòu)優(yōu)化分析；
10) UTR分析；
11) 反義轉(zhuǎn)錄本預測；
12) 重復相關性檢測（有生物學重復）；
13) 不同樣品表達量對比（兩個或以上樣品）；
14) 差異表達基因篩選（兩個或以上樣品）；
15) 差異表達基因聚類分析（兩個或以上樣品）；
16) 差異表達基因的功能注釋及富集分析(兩個或以上樣品)： 差異表達基因GO功能富集；差異表達基因COG分類；差異表達基因KEGG注釋；差異表達基因KEGG通路富集分析；
17) sRNA分析。
結(jié)果展示
送樣建議
1) 樣品類型：總RNA；
2) 樣品濃度：≥50ng/μg；
3) RNA總量：≥2μg；
4) RNA純度：OD260/280：1.8-2.0；OD260/230≥1.8，260處有正常峰值；
5) RNA完整度：RIN≥6.8。
