產(chǎn)品簡(jiǎn)介

長(zhǎng)鏈非編碼RNA測(cè)序（lncRNA Sequencing）是一種使用特定方法降低樣本中rRNA豐度，對(duì)富集到的RNA進(jìn)行文庫(kù)構(gòu)建，再對(duì)測(cè)序數(shù)據(jù)進(jìn)行信息分析的研究方法?？梢淮潍@得樣本中幾乎全部的lncRNA信息，對(duì)lncRNA的類(lèi)別、功能進(jìn)行全方位深入分析，從而快速全面準(zhǔn)確地獲得與特定生物學(xué)過(guò)程相關(guān)的lncRNA的信息。

研究?jī)?nèi)容

1) 測(cè)序質(zhì)量值分布統(tǒng)計(jì)；

2) 測(cè)序數(shù)據(jù)產(chǎn)出統(tǒng)計(jì)；

3) 與參考基因組比對(duì)分析；

4) RNA-Seq整體質(zhì)量評(píng)估：Insert長(zhǎng)度檢驗(yàn)；測(cè)序隨機(jī)性分析；測(cè)序飽和度分析；

5) 轉(zhuǎn)錄本拼接；

6) 已知lncRNA比對(duì)分析與統(tǒng)計(jì)；

7) 候選lncRNA基本篩選；

8) class_code的分布；

9) 候選lncRNA編碼潛能篩選（CPC、CNCI分析，pfam蛋白結(jié)構(gòu)域分析，編碼潛能預(yù)測(cè)維恩圖）；

10) 最終過(guò)濾結(jié)果管道圖；

11) lncRNA靶基因預(yù)測(cè)（trans和cis作用）；

12)  lncRNA表達(dá)定量分析；

13) lncRNA差異表達(dá)分析；

14) 樣品間lncRNA相關(guān)性分析（含生物學(xué)重復(fù)樣品）；

15)Cis作用差異lncRNA靶基因注釋富集分析；

16)Cis作用差異lncRNA靶基因PPI分析；

17)Trans作用差異lncRNA靶基因注釋富集分析；

18) Trans作用差異lncRNA靶基因PPI分析；

19)mRNA基因表達(dá)定量；

20)重復(fù)相關(guān)性檢測(cè)（有生物學(xué)重復(fù)）；

21) 差異表達(dá)基因篩選（兩個(gè)或以上樣品）；

22) 差異表達(dá)基因聚類(lèi)分析（兩個(gè)或以上樣品）；

23)差異表達(dá)基因的功能注釋?zhuān)▋蓚€(gè)或以上樣品）；

24)差異表達(dá)基因的GO和KEGG富集分析（兩個(gè)或以上樣品）；

25)差異表達(dá)基因蛋白互作網(wǎng)絡(luò)；

26)lncRNA與mRNA表達(dá)水平比較；

結(jié)果展示

送樣建議